体内细胞代谢的主要场来所是细胞质基质。它是细胞进行新陈代谢的主要场所，各种生化反应就在细胞质基质中完成。细胞质在细胞膜以内、细胞核以外的部分。活细胞中的细胞质外于不断流动的状态。细胞质包括细胞质基质和各种细胞器。在细胞质基质中，含有水、无机盐离子、脂质糖类、氨基酸和核苷酸等，还有很多种酶。

       细胞质基质的化学组成可按其相对分子质量大小分为三类，即小分子、中等分子和大分子。小分子包括水、无机离子;属于中等分子的有脂类、糖类、氨基酸、核苷酸及其衍生物等;大分子则包括多度糖、蛋白质、脂蛋白和RNA等。在细胞质基质中，进行多种化学反应。胞质溶胶约占细胞总体积55%，其中存在几千种酶。大多内数中间代谢（包括糖酵解、糖原异生作用以及糖、脂肪酸、核苷酸和氨基酸的合成）都是在胞质溶胶中进行的。胞质溶胶内约20% 是蛋白质。
       许多蛋白质可能直接或间接地与细胞骨架相结合，蛋白质分子之间也可能有选择性的亲合容。因此，细胞质基质实质上是一个在不同层次均有高度组织结构的系统，而不是一种简单的溶液。然而，在普通透射电子显微镜下却看不到细胞质基质内的有形构造。